王石被踢出万科的主要原因是由于他在公司内部和董事会之间出现了严重的分歧和冲突。在过去的几年里，王石在公司经营和管理方面的决策与其他高管和董事会成员存在较大分歧，导致了公司内部的不稳定和紧张局面。最终，董事会认为王石无法有效地领导公司，决定将其解除职务。此举旨在维护公司的长远利益和稳定发展。经过一系列程序和决策，王石最终被踢出了万科。